Las áreas estratégicas del TecNM en las cuales se concentran las líneas de investigación son:
1. Química, Ambiental, Polímeros, Catálisis
2. Ciencias de la Computación
3. Ingeniería Química, Bioquímica, Biotecnológica, Ciencias de los Alimentos, Ciencias del Mar y Agropecuarias
4. Ingenierías Eléctrica, Electrónica y Biomédica
5. Administración, Planificación, Desarrollo Regional, Ingeniería Administrativa, Industrial y de Gestión Empresarial
6. Mecánica, Mecatrónica, Metalúrgica y Materiales